Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pacsin2Q9WVE8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin2Q9WVE8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms