Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme3Q9WV85 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms