Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srd5a3Q9WUP4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srd5a3Q9WUP4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms