Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP1

Ramp3, Receptor activity-modifying protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp3Q9WUP1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms