Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scnn1bQ9WU38 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scnn1bQ9WU38 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scnn1bQ9WU38 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scnn1bQ9WU38 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scnn1bQ9WU38 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Scnn1bQ9WU38 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scnn1bQ9WU38 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Scnn1bQ9WU38 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scnn1bQ9WU38 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms