Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ptpn4Q9WU22 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptpn4Q9WU22 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms