Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrf1Q9WU00 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrf1Q9WU00 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms