Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms