Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhx6Q9R1R0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms