Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Htra1Q9R118 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms