Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N9

Syt9, Synaptotagmin-9, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt9Q9R0N9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syt9Q9R0N9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt9Q9R0N9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms