Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nek3Q9R0A5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms