Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtsjQ9R014 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsjQ9R014 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms