Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tnnt3Q9QZ47 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms