Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp3Q9QY23 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp3Q9QY23 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms