Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW9

Slc7a8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a8Q9QXW9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc7a8Q9QXW9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc7a8Q9QXW9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc7a8Q9QXW9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc7a8Q9QXW9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc7a8Q9QXW9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc7a8Q9QXW9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc7a8Q9QXW9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc7a8Q9QXW9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc7a8Q9QXW9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc7a8Q9QXW9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms