Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf354bQ9QXT9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf354bQ9QXT9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms