Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rad18Q9QXK2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad18Q9QXK2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms