Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cln8Q9QUK3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms