Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmub1Q9JMG3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmub1Q9JMG3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmub1Q9JMG3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmub1Q9JMG3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmub1Q9JMG3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmub1Q9JMG3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmub1Q9JMG3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmub1Q9JMG3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmub1Q9JMG3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms