Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cul3Q9JLV5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cul3Q9JLV5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms