Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh9a1Q9JLJ2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms