Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancaQ9JL70 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FancaQ9JL70 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms