Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gde1Q9JL56 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gde1Q9JL56 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms