Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bace2Q9JL18 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms