Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upk3aQ9JKX8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 701.5 ms