Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb3Q9JKS4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms