Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx6Q9JKK1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stx6Q9JKK1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms