Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl39Q9JKF7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms