Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ybx3Q9JKB3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms