Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Msgn1Q9JK54 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Msgn1Q9JK54 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms