Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Tuba8Q9JJZ2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Tuba8Q9JJZ2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Tuba8Q9JJZ2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Tuba8Q9JJZ2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Tuba8Q9JJZ2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Tuba8Q9JJZ2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Tuba8Q9JJZ2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Tuba8Q9JJZ2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tuba8Q9JJZ2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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