Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx20Q9JJY4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ddx20Q9JJY4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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