Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Alyref2Q9JJW6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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