Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms