Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Efcc1Q9JJF6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Efcc1Q9JJF6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms