Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Riox1Q9JJF3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Riox1Q9JJF3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms