Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc12a4Q9JIS8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms