Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Praf2Q9JIG8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms