Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ClpxQ9JHS4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpxQ9JHS4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms