Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
RabggtaQ9JHK4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RabggtaQ9JHK4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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