Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Cldn19Q9ET38 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
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Cldn19Q9ET38 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Cldn19Q9ET38 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Cldn19Q9ET38 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Cldn19Q9ET38 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Cldn19Q9ET38 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Cldn19Q9ET38 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Cldn19Q9ET38 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Cldn19Q9ET38 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Cldn19Q9ET38 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Cldn19Q9ET38 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Cldn19Q9ET38 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn19Q9ET38 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Cldn19Q9ET38 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Cldn19Q9ET38 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn19Q9ET38 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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