Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim39Q9ESN2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Trim39Q9ESN2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim39Q9ESN2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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