Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm7Q9ESD6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm7Q9ESD6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms