Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrnb2Q9ERK7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrnb2Q9ERK7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms