Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snap29Q9ERB0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snap29Q9ERB0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms