Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clstn2Q9ER65 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clstn2Q9ER65 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms