Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr9Q9EQU3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr9Q9EQU3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr9Q9EQU3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr9Q9EQU3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr9Q9EQU3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr9Q9EQU3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr9Q9EQU3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr9Q9EQU3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr9Q9EQU3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr9Q9EQU3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr9Q9EQU3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr9Q9EQU3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr9Q9EQU3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr9Q9EQU3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms