Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chst1Q9EQC0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms