Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r48Q9EQ52 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r48Q9EQ52 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms